Les unités paysagères composant le territoire sont essentiellement celles de l’Auxois, du Morvan, puis celles d’Arnay, des Hautes Vallées de l’Ouche et dans une moindre mesure celles du plateau du Châtillonnais et du Dijonnais.
L’Auxois est une région naturelle correspondant à un fossé entre les plateaux de Langres-Châtillonnais et le Morvan. Le Pays d’Auxois, au sens historique, « Alesiensis pagus », était un comté qui fut associé au Duché de Bourgogne en 1082. Il était divisé en bailliage principal de Semur-en-Auxois et bailliages particuliers d’Avallon, d’Arnay-le-Duc et de Saulieu.